秦朝中央官的基本構成是三公列卿。
三公指丞相、太尉、御史大夫。丞相是最高行政長官。《漢書·百官公卿表》説：“掌丞天子，助理萬機。”也就是説丞相的職責是按照皇帝的旨意，協助管理國家的政務。秦朝丞相或設一人，或設左、右各一人。宦官也可以任丞相，稱中丞相。丞相的屬官有侍中，負責殿中奏事，為首者稱僕射〔ye葉〕；舍人，協助丞相處理公私事務。太尉是最高軍事長官，主管武官的任免黜[chu觸]陟[☆☆zhi至]。不過秦代何人曾任太尉一職，已難考究，有的學者認為或設其位而虛其職。御史大夫為丞相之副，一方面供內庭差遣，另一方面又握有監察百官之權。下設丞和中丞。丞是大夫的助理，中丞在殿中蘭台主管圖書祕籍，因御史大夫參與議政，其監察百官之責往往落在中丞身上，故又有“御史亞長”、“貳大夫”之稱（《歷代職官表》引《御史中丞廳壁記》）。中丞之下又有侍御史，除負責記事、起草詔令、管理符璽外，也有糾察百官之責。三公分權，彼此制約。
列卿是三公之外高級官吏的統稱。主要有：奉常，掌管宗廟禮儀。有丞一人。屬官太樂、太祝、太宰、太醫、太史、太卜，皆有令、丞，分管樂舞、祭祀、饌具、巫醫、觀測天文、卜筮等事。又有專司議論的博士，設員多達70人，為首者稱僕射。
秦代博士是中央官中極具特色的一種官員。博士，原是春秋以來對學者的一種稱謂，多為儒家學者。到戰國末，博士才成為一些諸侯國的官名。秦統一後，博士雖為朝廷之官，卻無固定職掌。《史記·秦始皇本紀》説：“博士雖七十人，特備員弗用。”博士任務有兩項。一是管理圖書典籍。秦始皇下焚書令時，允許“博士官所職”圖書、諸子百家之典籍不燒，説明博士有管理圖書典籍的職責。二是備顧問。博士雖隸屬奉常，但可以在皇帝面前與丞相一起議論朝政，他們博學多聞，引經據典，供皇帝諮詢。至於他們的意見是否被採納，則取決於皇帝。
郎中令，掌管宮殿門户。有丞一人。屬官有大夫、郎、謁者。大夫分諫大夫、太中大夫、中大夫。郎分中郎、郎中。大夫負責諫議，備皇帝顧問。郎負責護衞、侍從。謁者負責內外傳達。
廷尉，主管刑獄。屬官有廷尉正、廷尉監。治粟內史，主管財政經濟。有丞二人。屬官有太倉令、丞等，分掌倉儲和物價。
典客，主管歸附各部族事務。有丞一人。屬官行人，充任朝廷臨時派出的使臣。
宗正，管理皇族事務。有丞一人。
衞尉，掌管宮門衞屯兵。屬官有公車司馬令、丞，衞士令、丞，分管司馬門（秦宮城的外門）和衞士。
太僕，掌管皇宮車馬和國家馬政。有丞二人。屬官大廄、未央、家馬三令。
典屬國，管理內附各部族入朝侍子。下設典客丞、九譯令。
主爵中尉，主管列侯封爵。
少府，掌管山海池澤之税，以供皇室享用。在列卿中，少府從屬官最龐雜。有御府令、丞，掌管供應御服。尚書令、丞及尚書，主管收發文書。符璽令、丞，掌管符璽信物。大官令、丞，掌管皇帝膳食。太醫令、丞，管理醫藥。都水長、丞，負責御苑陂池灌溉。樂府令、丞，主管音律樂章。宦者令、丞，主管宦官。中書謁者令、丞，掌管內廷事務。主巷令，掌管宮人。又有六尚之稱，除尚書外，還有尚冠、尚衣、尚食、尚沐、尚席，分管皇帝日常生活之事。
將作少府，主管宮室修建。有兩丞及左、右中候，屬官左、右、中、前、後五校令丞，分管徒隸（服役的犯人）。
除上述列卿外，還有宮官。宮官是皇后（指皇帝的正妻）、皇太子（指皇帝的繼承人）屬下的官吏。皇后宮有卿，稱將行。又有詹事、皇后尉、皇后少府、皇后少僕。太子宮稱家，有詹事、丞、太子家令、太子率更令、衞率、中庶子、太子舍人、太子門大夫、少庶子、洗馬、太子僕等。詹事，有省視之意，是宮官之長。率更令，負責報告晨昏時辰。衞率，掌管太子家門衞。洗馬、庶子等都是太子的侍從。
秦朝除太尉外，高級武官還有護軍都尉。護軍都尉主管軍政，統領外地諸將。將軍，位上卿，其副職稱裨〔pi皮〕將。秦統一後，將軍一職由原來的戰時任命改為駐守於邊地的常設武官。下有長史。中下級武官有校、軍候、司馬、百將、屯長、騎長等。
秦朝設官有職、爵、秩的區別。職是官員的實際職務。職務高低以印綬為標誌。印綬分別為金印紫綬、銀印青綬、銅印墨綬、銅印黃綬。綬是印紐的絲帶。丞相就是金印紫綬，御史大夫銀印青綬，縣丞銅印黃綬。前面(1)、(2)所列，都是官職。爵主要用於獎勵有功者，仍用戰國時候的二十級軍功爵。受爵者無封土，僅侯爵保留享有封地內徵收租税的特權，稱食邑。秩表示官員等級高低，以俸祿多少為標準，計算單位是石〔shi時〕。除丞相外，最高為二千石，次為千石，再次為八百石，又次為六百石。以下遞減為五百石、四百石、三百石、二百石、一百石。百石之下為斗食。
職與秩、爵有一定聯繫，即有功於國家，或為皇帝親信，可授予高級別的職、秩、爵。但三者之間不能劃等號。如受爵的不一定是官，一至四等就是軍士爵。高官也不一定封爵，如李斯，先後擔任廷尉和丞相，卻沒有爵位。又如各縣令(長)，從職上講相同，均為銅印墨綬，但從秩上講有千石、八百石、六百石三種，又不盡相同。
秦朝地方分郡、縣兩級。除京師外，最初置36郡，以後又陸續增加到40餘郡。京師咸陽所在的關中地區被視為特別行政區，設內史，地位高於列郡，相當於列卿。
郡之組織有守、尉、監（監郡御史），與中央三公設置相呼應。郡守為一郡之長，舉凡郡內民政、賦税、司法等事務，均由郡守負責。下設郡丞為佐助，邊郡則另設長史管兵馬。郡尉低於郡守，任務是協助郡守管理甲卒，維持地方治安。關塞地區設關都尉。郡監不是郡守的副貳，而直屬中央的御史大夫，是中央派往地方的監察官，對郡守、郡尉有監督作用。
郡下組織是縣，少數民族地區則設道。縣按大小設令或長，縣民萬户以上置令，萬户以下置長，均由朝廷任命。令、長主持一縣的行政，下設丞、尉二職。丞是令、長的佐助官。尉掌一縣之甲兵，負責治安。
縣以下有鄉，鄉設三老、有秩、嗇夫、遊徼[jiao叫]。三老負責教化。有秩設於大鄉，嗇夫設於小鄉，負責賦税和訴訟。遊徼負責治安。鄉下有裏，是最基層的行政單位。裏設裏典，後代稱里正、裏魁。此外還有司治安、禁盜賊的專門機構，叫作亭，亭有亭長。兩亭相距大約10裏。
秦朝地方郡、縣、鄉、裏、亭之設，説明中央權力已係統地分佈在國家每一個角落。
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