1、增加了預案發布後備案時限要求以及受理備案的時限要求。規定地方各級安全生產監管監察部門應急預案、生產經營單位應急預案應當自發布之日起30個工作日內按照本辦法規定進行備案。規定受理備案登記的安全生產監督管理部門應當在受理申請之日起20個工作日內對應急預案進行形式審查的要求。
2、關於備案要求的調整。明確提出中央企業總部的綜合應急預案和專項應急預案，應報國務院安全生產監督管理部門和有關主管部門備案；其所屬的各級分(子)公司綜合應急預案和專項預案按照隸屬或業務關係報所在地人民政府安全生產監督管理部門和有關主管部門備案。
此外，前款規定以外的其他生產經營單位中涉及煤礦、非煤礦山、冶金、建築施工單位和易燃易爆物品、危險化學品、放射性物品等危險物品的生產、經營、儲存、使用單位和中型規模以上的其他生產經營單位，有安全生產行政許可的，其綜合應急預案和專項應急預案報行政許可部門備案，抄送所在地安全生產監督管理部門。無安全生產行政許可的，其綜合應急預案和專項應急預案按照隸屬或業務關係報所在地縣級以上地方人民政府安全生產監督管理部門和有關主管部門備案。
本章進行了較大幅度修改，保留了原《管理辦法》中的第5條和第12條，其他條均進行了修改或完善。具體情況如下：
1、將原《管理辦法》中的第6條提前，並修改了部分內容，明確提出“地方各級安全生產監督管理部門應當根據法律、法規、規章和同級人民政府以及上級部門的應急預案和應急預案編制方面的規範要求，結合本行政區域主要生產安全事故風險，組織、指導編制相應部門的應急預案。同時，編制與預案相對應的簡明操作程序手冊，明確職責任務及應急處置流程、應急保障措施等內容”，增加了“應急預案編制方面的規範要求”、“結合本行政區域主要生產安全事故風險，組織、指導編制相應部門的應急預案”、“編寫與預案相對應的簡明操作程序手冊”等要求。
2、將原《管理辦法》中的第7條中的《生產經營單位安全生產事故應急預案編制導則》(AQ/T9002-2006)替換為《生產經營單位生產安全事故應急預案編制導則》(GB/T 29639)，刪除了“結合本單位的危險源狀況、危險性分析情況和可能發生的事故特點”的要求，改為“結合本單位實際”。
3、依據《生產經營單位生產安全事故應急預案編制導則》(GB/T 29639)內容，在新修訂的《管理辦法》的第8、9、10條中重新描述了生產經營單位的綜合應急預案、專項應急預案和現場處置方案的概念和編寫要求。
4、規定了生產經營單位在建設項目施工前和投產試運行前應編制完成相應應急預案編制工作。建設項目的施工單位、工程監理單位及其他與建設項目安全生產有關的單位的應急預案應納入建設單位的應急預案體系。
5、增加了應急預案編制前開展風險評估和應急能力評估的要求，並且要求加強應急能力建設並及時根據風險評估和應急能力評估結果，完善生產安全事故風險防控措施，配置相應應急物資和裝備，把應急準備貫穿應急預案編制的全過程。
6、修改了原《管理辦法》中的第5條（現第13條）應急預案的編制應當符合下列基本要求中的第4、5、7、8款內容。
7、增加了第14條，規定了生產經營單位承擔本單位應急預案編制的主體責任，可邀請相關中介機構或專家進行指導，但不得全權委託其他單位或個人編制應急預案。
8、增加了第15條，要求應急預案評審前，應當組織預案涉及的相關部門或人員對預案進行桌面演練，通過桌面演練來檢驗和完善應急預案。
沒有較大修改，增加了“本辦法自2013年×月×日起施行，2009年5月1日起實施的《生產安全事故應急預案管理辦法》同時廢止”的説明。
五、基本框架
根據部門規章起草的基本規則，《生產安全事故應急預案管理辦法》的框架分為七章，包括總則、應急預案的編制、應急預案的評審與公佈、應急預案的備案、應急預案的實施、監督管理、附則等內容。
新修訂的《管理辦法》總共包括7章、47條規定，具體修訂情況如下：
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