常用的傳染病化驗檢查包括微生物培養、病毒分離、核酸檢測、抗體檢測等。微生物培養一般用於細菌檢查。例如血液微生物培養可以發現血液中的細菌到底是鏈球菌還是金黃色葡萄球菌。咽拭子和呼吸道分泌物培養可以發現呼吸道感染了什麼細菌。例如導致猩紅熱的鏈球菌就可以通過咽拭子培養明確診斷 ，導致細菌性痢疾的病原體志賀菌可以通過糞便培養來診斷。
對於病毒感染來説 ，雖然從標本中分離出病毒是最權威的確診依據 ，但是病毒分離是比較危險的操作 ，需要在較高防護等級的實驗室進行 ，一般的醫療機構不具備這樣的條件 ，所以目前更多的是通過檢測血液中是否有病毒的抗體來判斷是否感染。例如甲肝、乙肝、丙肝、艾滋病、麻疹等傳染病都是通過檢測標本中是否有病毒抗體來協助診斷的。
抗體檢測的優點是方便快捷 ，準確率也比較高 ，通常十幾分鍾到1小時就可以出結果。但抗體檢測的缺點是人感染病毒後往往需要一定時間才能產生抗體 ，從感染到能夠檢測到抗體的這段時間就是窗口期。例如乙肝、丙肝、艾滋病感染後需要2至3周才能產生抗體 ，新型冠狀病毒感染後需要至少3天以上才能檢測到IgM抗體(免疫球蛋白M ，在感染早期發揮清除病毒的作用) ，一週以上才能檢測到IgG抗體(免疫球蛋白G ，體內最重要的抗體)。
核酸檢測也是檢測病毒的方法 ，它可以更早發現感染。現在臨牀中對乙肝、丙肝、艾滋病都開展了核酸檢測，可以在抗體產生前檢測到血液中是否存在病毒。而一些呼吸道疾病可以通過咽拭子或者呼吸道分泌物的核酸檢測來判斷是否感染 ，以及推測是否具有傳染性。季節性流感、禽流感、冠狀病毒感染等通過咽拭子檢測可以方便地判斷出上呼吸道是否存在病毒成份 ，從而判斷被檢測者是否屬於感染者。
新冠病毒的核酸檢測已經是比較成熟的檢測方法了 ，只要在咽喉部位擦拭幾秒鐘就可以採集到標本。通過分析判斷是否有新冠病毒的核酸成分 ，可以儘早發現感染者 ，甚至在感染者出現症狀前就可以檢測到陽性。感染者經過隔離治療後咽拭子檢測陰性説明病毒已經清除 ，不具有傳染性了。目前兩次咽拭子核酸檢測陰性是確診病例和無症狀感染者解除隔離的標準之一。
1、檢測前。每個醫院都是有核酸檢測採樣區的 ，這種地方一般會有大量採樣者 ，大家在檢測的時候 ，為了避免交叉感染 ，應該要正確的佩戴口罩 ，然後按照順序和提示消毒後進入採樣區 ，還有在核酸檢測採樣前30分鐘應避免喝水、吃飯、抽煙、喝酒等行為。
2、檢測中。在做核酸檢測的過程中 ，很有可能會給人體帶來不適的症狀 ，像是噁心 ，要知道這是正常的生理反應 ，大家在檢測之前應該要好準備 ，消除恐懼心理 ，做檢測的時候需要儘量放鬆 ，保持頭部後仰 ，張嘴以便採樣順利進行 ，這樣能夠減少不適感。
3、檢測後。核酸檢測採樣完成之後 ，應該要快速的離開採集點 ，不要在採樣點長時間逗留 ，更不可以在採集點周圍吐痰、嘔吐 ，大家在離開採樣點在之後 ，需要及時的對自己的手部和衣物進行消毒 ，這樣能夠避免造成交叉感染。
4、其他注意事項。核酸檢測採集人員通常都會防護嚴密 ，説話可能會不清楚 ，聽力也會遭受影響 ，為提高效率 ，被檢測者應提前準備好身份證或户口本 ，準備紙巾 ，可將身份證號碼、家庭住址、聯繫電話等信息提前寫好交於工作人員。
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